MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis MC28 plasmid pMC54

Total Repeats: 273

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018694	TAA	2	6	23	28	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018694	GAA	2	6	36	41	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018694	TGA	2	6	56	61	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018694	GAA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018694	GCT	2	6	690	695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018694	AGG	2	6	733	738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018694	AGG	2	6	1938	1943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018694	T	6	6	2953	2958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018694	AAAC	2	8	2963	2970	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018694	TTA	2	6	2977	2982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018694	T	6	6	3000	3005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018694	T	6	6	12193	12198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018694	AGA	2	6	16118	16123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018694	GCA	3	9	20654	20662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018694	T	6	6	20666	20671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018694	AGG	2	6	20691	20696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018694	TCA	2	6	20723	20728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018694	T	7	7	22371	22377	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018694	A	7	7	22391	22397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018694	T	6	6	22403	22408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018694	TATT	2	8	22424	22431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018694	TAA	2	6	22456	22461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018694	AGG	2	6	22475	22480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018694	TGGAT	2	10	22490	22499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018694	TTC	2	6	22548	22553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018694	TAC	2	6	22579	22584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018694	GAA	2	6	22594	22599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018694	AG	3	6	22651	22656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018694	CT	3	6	22663	22668	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018694	TA	3	6	22696	22701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018694	A	6	6	22707	22712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018694	ACA	2	6	22774	22779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018694	ATG	2	6	22833	22838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018694	T	7	7	23120	23126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018694	AAAT	2	8	23144	23151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018694	A	6	6	23183	23188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018694	TACT	2	8	23229	23236	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018694	G	6	6	23302	23307	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018694	ATTT	2	8	23323	23330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018694	T	6	6	23357	23362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018694	CTTT	2	8	23520	23527	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018694	A	6	6	24158	24163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018694	CTT	2	6	24271	24276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_018694	TA	3	6	24311	24316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018694	AAT	2	6	24317	24322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018694	AAATT	2	10	24373	24382	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018694	ATT	2	6	24396	24401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018694	T	6	6	24412	24417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018694	TTA	2	6	24423	24428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018694	A	6	6	25833	25838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018694	T	6	6	25860	25865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018694	ATC	2	6	26110	26115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_018694	TTTA	2	8	26181	26188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018694	AC	3	6	26543	26548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_018694	GTG	2	6	27813	27818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018694	ACT	2	6	27826	27831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018694	ACT	2	6	27888	27893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018694	A	6	6	27920	27925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018694	AGT	2	6	27928	27933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018694	AGG	2	6	28513	28518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018694	ACA	2	6	28542	28547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_018694	TAT	2	6	28556	28561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018694	TTC	2	6	28578	28583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018694	AAT	2	6	28597	28602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018694	AAT	2	6	28978	28983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018694	AGT	2	6	29013	29018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018694	TCT	2	6	29049	29054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018694	T	6	6	29054	29059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018694	GGT	2	6	29113	29118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018694	TGTA	2	8	29138	29145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018694	AGG	2	6	29153	29158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018694	ATG	2	6	29167	29172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018694	TTG	2	6	29200	29205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018694	AAAC	2	8	29241	29248	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018694	A	6	6	29266	29271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018694	TCT	2	6	29311	29316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_018694	T	6	6	29332	29337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018694	AGA	2	6	29369	29374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018694	TCT	2	6	29389	29394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018694	TTTAT	2	10	29395	29404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018694	TAA	2	6	29410	29415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018694	TG	4	8	29442	29449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018694	A	6	6	29450	29455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018694	GTAA	2	8	29512	29519	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018694	TA	3	6	29528	29533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018694	AT	3	6	29539	29544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018694	GAT	2	6	29666	29671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018694	AGT	2	6	29673	29678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018694	TCC	2	6	29796	29801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_018694	CGC	2	6	29819	29824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_018694	ACC	2	6	29829	29834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_018694	CCT	2	6	29854	29859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_018694	AAG	2	6	29866	29871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018694	AGG	2	6	29880	29885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018694	AATT	2	8	29932	29939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018694	A	7	7	29960	29966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018694	GTT	2	6	29998	30003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018694	ATC	2	6	30021	30026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018694	TAT	2	6	30049	30054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018694	AT	4	8	30056	30063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018694	ATG	2	6	30102	30107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018694	ATAA	2	8	30196	30203	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018694	AAT	2	6	30244	30249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018694	CT	3	6	30261	30266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_018694	ATT	2	6	30286	30291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018694	AGG	2	6	30315	30320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018694	ATA	2	6	30329	30334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018694	GCC	2	6	30342	30347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018694	TAT	2	6	30350	30355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018694	TAA	2	6	30368	30373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018694	TCT	2	6	30406	30411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018694	TAA	2	6	30417	30422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018694	ATT	2	6	30424	30429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018694	T	7	7	30428	30434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018694	TAATA	2	10	30448	30457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018694	TTA	2	6	30465	30470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018694	ATT	2	6	30472	30477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018694	CCT	2	6	30499	30504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_018694	AG	4	8	30560	30567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018694	GGC	2	6	33388	33393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018694	T	6	6	33429	33434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018694	T	6	6	33436	33441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018694	CTT	2	6	33495	33500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_018694	A	6	6	33522	33527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018694	AAAAG	2	10	33535	33544	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018694	CGT	2	6	33547	33552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018694	A	6	6	33586	33591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018694	TTAG	2	8	33607	33614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018694	GTAA	2	8	33669	33676	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018694	TAA	2	6	33684	33689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018694	TCT	2	6	33736	33741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_018694	TTTAT	2	10	33742	33751	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018694	AAAAG	2	10	33803	33812	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018694	TTC	2	6	33832	33837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018694	TTTAAT	2	12	33852	33863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018694	CTT	2	6	33925	33930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018694	T	6	6	33969	33974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018694	ATA	2	6	34011	34016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018694	T	7	7	34540	34546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018694	TA	3	6	34570	34575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018694	TAA	3	9	34593	34601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018694	CTT	2	6	34656	34661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_018694	CATG	2	8	34670	34677	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018694	CAA	2	6	34722	34727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_018694	CAA	2	6	34740	34745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_018694	ACAA	2	8	34833	34840	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018694	A	6	6	34839	34844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018694	CT	4	8	34856	34863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018694	A	6	6	34865	34870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018694	T	8	8	35278	35285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.